एंजाइम को शिथिल धनायनों और कम ग्लूटाथियोन द्वारा सक्रिय किया जाता है। मानव ट्रांसफ़ेक्ट सल्फेट से एंजाइम आंतरिक अवशेषों और गैर-कम करने वाले टर्मिनल गाल्नक 6-सल्फेट अवशेषों में से 4 की स्थिति में चोंड्रोइटिन सल्फेट को स्थानांतरित करता है। चोंड्रोइटिन सल्फेट से प्राप्त ओलिगोसैकेराइड भी स्वीकर्ता के रूप में काम करते हैं लेकिन चोंड्रोइटिन सल्फेट ई, केराटन सल्फेट और हेपरान सल्फेट नहीं करते हैं। ईसी से कठिनाइयाँ 2.8.2.17, चोंड्रोइटिन 6-सल्फ़ोट्रांसफेरेज़, चोंड्रोइटिन और डर्माटन दोनों को प्रभावी सब्सट्रेट के रूप में उपयोग करने में सक्षम होने में।
